Protein–RNA interactions for Protein: O70494

Sp3, Transcription factor Sp3, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp3O70494 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sp3O70494 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms