Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snx3O70492 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx3O70492 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms