Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lnx1O70263 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lnx1O70263 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms