Protein–RNA interactions for Protein: O55241

Hcrt, Orexin, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HcrtO55241 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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HcrtO55241 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HcrtO55241 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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