Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ldb2O55203 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ldb2O55203 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ldb2O55203 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ldb2O55203 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ldb2O55203 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ldb2O55203 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ldb2O55203 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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