Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PrxO55103 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PrxO55103 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PrxO55103 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PrxO55103 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PrxO55103 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PrxO55103 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrxO55103 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrxO55103 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PrxO55103 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PrxO55103 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PrxO55103 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms