Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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BckdkO55028 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
BckdkO55028 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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