Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DffaO54786 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DffaO54786 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DffaO54786 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
DffaO54786 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DffaO54786 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DffaO54786 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
DffaO54786 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
DffaO54786 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
DffaO54786 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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