Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
CrxO54751 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
CrxO54751 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
CrxO54751 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CrxO54751 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CrxO54751 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
CrxO54751 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
CrxO54751 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
CrxO54751 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms