Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cavin1O54724 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cavin1O54724 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms