Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sp100O35892 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Sp100O35892 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sp100O35892 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sp100O35892 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Sp100O35892 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sp100O35892 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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