Protein–RNA interactions for Protein: O35739

Klf9, Krueppel-like factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf9O35739 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Klf9O35739 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Klf9O35739 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Klf9O35739 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Klf9O35739 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Klf9O35739 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Klf9O35739 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Klf9O35739 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Klf9O35739 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Klf9O35739 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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