Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ppfibp2O35711 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ppfibp2O35711 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms