Protein–RNA interactions for Protein: O35604

Npc1, Niemann-Pick C1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npc1O35604 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Npc1O35604 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms