Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ccrl2O35457 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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