Protein–RNA interactions for Protein: O35372

Cnih1, Protein cornichon homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih1O35372 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cnih1O35372 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Cnih1O35372 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms