Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Kpna3O35344 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kpna3O35344 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms