Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kpna4O35343 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms