Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ptpn9O35239 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms