Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snap23O09044 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snap23O09044 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms