Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EllO08856 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EllO08856 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
EllO08856 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EllO08856 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EllO08856 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EllO08856 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EllO08856 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EllO08856 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
EllO08856 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
EllO08856 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
EllO08856 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms