Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gfra2O08842 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gfra2O08842 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms