Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3278L7N2D2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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Gm3278L7N2D2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm3278L7N2D2 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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