Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3542K7N6U2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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