Protein–RNA interactions for Protein: K7N6B6

Vmn1r168, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r168K7N6B6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vmn1r168K7N6B6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms