Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm379J3QQ19 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm379J3QQ19 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm379J3QQ19 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm379J3QQ19 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm379J3QQ19 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm379J3QQ19 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm379J3QQ19 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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