Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Gm2035J3QP87 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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