Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm20918J3QN17 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Gm20918J3QN17 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gm20918J3QN17 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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