Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK1

Sgo2b, Shugoshin 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2bJ3QMK1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sgo2bJ3QMK1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms