Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm21818J3KMS6 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm21818J3KMS6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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