Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Usp9yF8VPU6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Usp9yF8VPU6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms