Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Farp1F8VPU2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Farp1F8VPU2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms