Protein–RNA interactions for Protein: F6YCR7

Rhox13, Homeobox protein Rhox13, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox13F6YCR7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhox13F6YCR7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms