Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
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Gm10378F6XQQ1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Gm10378F6XQQ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
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Gm10378F6XQQ1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Gm10378F6XQQ1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm10378F6XQQ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Gm10378F6XQQ1 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
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Gm10378F6XQQ1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm10378F6XQQ1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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