Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Crocc2F6XLV1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Crocc2F6XLV1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms