Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Gm28305F6U473 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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