Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3U3

Raph1, Ras association (RalGDS/AF-6) and pleckstrin homology domains 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Raph1F2Z3U3 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Raph1F2Z3U3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Raph1F2Z3U3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms