Protein–RNA interactions for Protein: E9QLQ1

Defa35, Defensin, alpha, 35, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa35E9QLQ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Defa35E9QLQ1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Defa35E9QLQ1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms