Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7F2

Rnf169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf169E9Q7F2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf169E9Q7F2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rnf169E9Q7F2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf169E9Q7F2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf169E9Q7F2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rnf169E9Q7F2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Rnf169E9Q7F2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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