Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Nolc1E9Q5C9 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nolc1E9Q5C9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms