Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC9.61□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
ApobE9Q414 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
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