Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Prdm14E9Q3T6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms