Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r238E9Q373 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r238E9Q373 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms