Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc171E9Q1U1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc171E9Q1U1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms