Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Gm3250E9Q1M3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm3250E9Q1M3 Gm42474-201ENSMUST00000201073 505 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms