Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Ryr1E9PZQ0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms