Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rsph10bE9PYQ0 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rsph10bE9PYQ0 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms