Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ccdc144bE9PVZ3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms