Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifit3bE9PV48 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms