Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Clca3bE9PUL3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clca3bE9PUL3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms